【作者】 汪虹； 陳明杰； 鮑大鵬；
【Author】 WANG Hong,CHEN Mingjie,BAO Dapeng National Engineering Research Center of Edible Fungi;Shanghai Key Laboratory of Agricultural Geneticsand Breeding;Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 201403,China
【機構(gòu)】 農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術(shù)研究中心上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所；
【摘要】 根據(jù)擔(dān)子菌絲/蘇氨酸蛋白激酶同源基因編碼的氨基酸序列設(shè)計兩對簡并引物,通過巢式簡并PCR方法獲得草菇(Volvariella volvacea)絲/蘇氨酸蛋白激酶同源基因(vv-stpk1)的保守片段,然后通過基因組步行的方法獲得了vv-stpk1全長序列。vv-stpk1全長為2 003 bp,含有8個內(nèi)含子,長度分別為72、57、53、54、45、50、55和48 bp,可編碼522個氨基酸殘基的多肽。推定的氨基酸序列與玉米黑粉菌(Ustilagomaydis)、木糖發(fā)酵酵母(Pichia stipitis)、新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)中與細胞形態(tài)發(fā)生相關(guān)的絲/蘇氨酸蛋白激酶Orb6的相似性分別為81%、77%和76%,對VV-STPK1蛋白的系統(tǒng)發(fā)生學(xué)分析的結(jié)果表明,VV-STPK1與Orb6同源蛋白聚在同一進化枝上,這些數(shù)據(jù)都支持VV-STPK1蛋白為與細胞形態(tài)發(fā)生相關(guān)同源蛋白的推定。
【Abstract】 Two pairs of degenerate primers,designed according to the conserved amino acid sequences of several basidiomycete ser/thr protein kinases,were used in nested PCR to amplify the corresponding conserved DNA sequence from Volvariella volvacea.The complete DNA sequence of the ser/thr protein kinase(vv-stpk1) was then obtained by genome walking.vv-stpk1 was 2 003 bp in size,encoding for 522 amino acids,and contained eight introns.VV-STPK1 exhibited 81%,77% and 76% similarity with Orb6,a ser/thr prote...
【關(guān)鍵詞】 草菇； 絲/蘇氨酸蛋白激酶； 克隆； 序列分析；
【Key words】 Volvariella volvacea； ser/thr protein kinase； gene clone； sequence analysis；
【基金】 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院院發(fā)基金[編號:上海農(nóng)科院農(nóng)科發(fā)2008(16)];上海市科委科技攻關(guān)重點項目(編號:10DZ2212400)的部分研究內(nèi)容
【分類號】S646.13