【作者】楊瑞恒 李焱 吳瑩瑩 唐利華 尚俊軍 鮑大鵬
【機構】上海市農業(yè)科學院食用菌研究所農業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術研究中心國家食用菌加工技術研發(fā)分中心 上海市農業(yè)遺傳育種重點開放實驗室
摘要:通過比較香菇(Lentinula edodes)野生菌株L3,NCBI已公布的菌株135A、135B、B17、NBRC 111202、W1-26,木腐菌金針菇(Flammulina velutipes)、糙皮側耳(Pleurotus ostreatus),以及草腐菌雙孢蘑菇(Agaricus bisporus)、灰蓋鬼傘(Coprinopsis cinerea)、草菇(Volvariella volvacea)的基因組。結果表明:香菇不同菌株間基因組存在較大差異,大小為36.69~46.11 Mb,基因數(shù)量為11192~14889;香菇菌株135A、135B、B17、L3、NBRC 111202和W1-26基因組注釋的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)基因數(shù)量分別為520、520、483、475、524和537,其中L3最少,為475;纖維素酶在香菇不同菌株中基因數(shù)量為19~22,低于灰蓋鬼傘和草菇,高于雙孢蘑菇;不同香菇菌株的氧化還原酶基因數(shù)量為41~55,L3最少,為41,NBRC111202最多,為55,135A和135B最為接近。在基因水平上,木腐菌與草腐菌的木質纖維素降解酶體系沒有完全的界限,它們之間存在一定的共性,因此木腐菌草腐化栽培存在可能性。
基金:上海市市級農口系統(tǒng)青年人才成長計劃[滬農青字(2017)第1-8號]; 上海市科技興農重點攻關項目[滬農科攻字(2016)第6-1-3號];
關鍵詞:碳水化合物活性酶; 纖維素酶; 木質素酶; 氧化還原酶;