【作者】肖冬來 馬璐 應(yīng)正河 江曉凌 林衍銓
【機構(gòu)】福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
摘要:通過轉(zhuǎn)錄組測序獲得了一個廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)編碼的溶血素基因(latifolysin),進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并利用實時定量PCR分析溶血素基因表達(dá)水平,采用同位素標(biāo)記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)標(biāo)記結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜鑒定分析溶血素表達(dá)差異。結(jié)果表明latifolysin基因全長為399bp,編碼133個氨基酸。保守功能域搜索顯示latifolysin具有與楊樹菇溶血素(aegerolysins)蛋白家族相同的結(jié)構(gòu)域和功能位點,兩者序列相似性40%。楊樹菇溶血素家族蛋白在真菌中呈不連續(xù)性分布。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示繡球菌溶血素隸屬于擔(dān)子菌類群,與草菇(Volvariella volvacea)遺傳關(guān)系較近。實時定量PCR和蛋白定量結(jié)果表明,latifolysin和繡球菌溶血素在廣葉繡球菌幼菇期表達(dá)量最高,且顯著高于菌絲體中表達(dá)水平。
基金:福建省屬公益類科研院所基本科研專項(2014R1020-1); 福建省種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程項目(2014S1477-8)資助;
關(guān)鍵詞:繡球菌; 楊樹菇溶血素; 溶血素; 實時定量PCR;
【機構(gòu)】福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
摘要:通過轉(zhuǎn)錄組測序獲得了一個廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)編碼的溶血素基因(latifolysin),進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并利用實時定量PCR分析溶血素基因表達(dá)水平,采用同位素標(biāo)記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)標(biāo)記結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜鑒定分析溶血素表達(dá)差異。結(jié)果表明latifolysin基因全長為399bp,編碼133個氨基酸。保守功能域搜索顯示latifolysin具有與楊樹菇溶血素(aegerolysins)蛋白家族相同的結(jié)構(gòu)域和功能位點,兩者序列相似性40%。楊樹菇溶血素家族蛋白在真菌中呈不連續(xù)性分布。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示繡球菌溶血素隸屬于擔(dān)子菌類群,與草菇(Volvariella volvacea)遺傳關(guān)系較近。實時定量PCR和蛋白定量結(jié)果表明,latifolysin和繡球菌溶血素在廣葉繡球菌幼菇期表達(dá)量最高,且顯著高于菌絲體中表達(dá)水平。
基金:福建省屬公益類科研院所基本科研專項(2014R1020-1); 福建省種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程項目(2014S1477-8)資助;
關(guān)鍵詞:繡球菌; 楊樹菇溶血素; 溶血素; 實時定量PCR;