【作者】徐珍 劉建雨 張丹 王瑞娟 潘迎捷 譚琦 尚曉冬
【機(jī)構(gòu)】上海海洋大學(xué)食品學(xué)院 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所 農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 國家食用菌工程技術(shù)研究中心國家食用菌加工技術(shù)研發(fā)中心 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室
摘要：以金針菇(Flammulinavelutipes)單核菌株DAN3的基因組為參考,完成單核體DAN3和M及其雜交雙核體G1在菌絲階段的轉(zhuǎn)錄組測序與數(shù)據(jù)分析,比較兩個樣本間的差異基因,并對差異基因進(jìn)行GO功能分析和KEGG pathway分析。結(jié)果表明:兩個樣本中共有顯著性差異表達(dá)的基因86個,其中,在G1中呈上調(diào)、下調(diào)表達(dá)的基因數(shù)分別為41、45個,有2個基因在G1中特異表達(dá)。GO功能分析結(jié)果表明,86個差異基因中有40個基因比對上了GO功能注釋,其中18個基因在G1中呈上調(diào)表達(dá);單一生物過程和催化活性為顯著性富集的功能,相關(guān)基因在G1中呈上調(diào)表達(dá)。KEGG pathway分析結(jié)果表明,22個差異基因被定位到17條Pathway,其中10個基因在G1中呈上調(diào)表達(dá),包括賴氨酸代謝途徑對應(yīng)基因,3_M和G1菌絲樣品中賴氨酸含量分別為1.70×103 ng/mg和1.06×103 ng/mg,說明G1中上調(diào)的基因可能與之降解相關(guān);DNA復(fù)制是顯著性富集的代謝途徑,相關(guān)基因在G1中呈下調(diào)表達(dá)。
基金：國家科技支撐項(xiàng)目(2013BAD16802)資助；
關(guān)鍵詞：菌絲; 轉(zhuǎn)錄組; 差異表達(dá)基因; GO功能分析; KEGG pathway分析;