【作者】王瑩 高英女 汪瀅 李燕 唐利 華白睿 鮑大鵬
【機構】國家食用菌工程技術研究中心農業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農業(yè)遺傳育種重點開放實驗室 上海市農業(yè)科學院食用菌研究所 上海海洋大學食品學院
摘要：利用生物信息學方法從蛋白質基本理化特性、信號肽和亞細胞定位、分子進化與翻譯后修飾位點以及蛋白質三維結構等方面,對南方靈芝(Ganoderma australe)中免疫調節(jié)蛋白c13717進行預測分析,并將c13717蛋白的分析結果與三種典型的真菌免疫調節(jié)蛋白(LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo)以及牛樟芝(Antrodia camphorata)中免疫調節(jié)蛋白ACA進行比較分析。結果發(fā)現(xiàn),c13717蛋白相對分子質量為14150,N端具有信號肽,亞細胞定位于細胞外,遺傳進化與ACA相近,而與LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo較遠,翻譯后修飾位點較少,蛋白三維結構含有cerato-platanin(CP)結構域,不具有真菌免疫調節(jié)蛋白典型的FNIII結構,證明c13717蛋白不屬于真菌免疫調節(jié)蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)家族,而屬于CP蛋白家族,可能具有獨特的生物活性。
基金：上海市農口青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-11號]、上海市農口青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-10號]項目資助；
關鍵詞：南方靈芝; 理論預測; 結構特征; 免疫調節(jié)蛋白;
【機構】國家食用菌工程技術研究中心農業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室上海市農業(yè)遺傳育種重點開放實驗室 上海市農業(yè)科學院食用菌研究所 上海海洋大學食品學院
摘要：利用生物信息學方法從蛋白質基本理化特性、信號肽和亞細胞定位、分子進化與翻譯后修飾位點以及蛋白質三維結構等方面,對南方靈芝(Ganoderma australe)中免疫調節(jié)蛋白c13717進行預測分析,并將c13717蛋白的分析結果與三種典型的真菌免疫調節(jié)蛋白(LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo)以及牛樟芝(Antrodia camphorata)中免疫調節(jié)蛋白ACA進行比較分析。結果發(fā)現(xiàn),c13717蛋白相對分子質量為14150,N端具有信號肽,亞細胞定位于細胞外,遺傳進化與ACA相近,而與LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo較遠,翻譯后修飾位點較少,蛋白三維結構含有cerato-platanin(CP)結構域,不具有真菌免疫調節(jié)蛋白典型的FNIII結構,證明c13717蛋白不屬于真菌免疫調節(jié)蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)家族,而屬于CP蛋白家族,可能具有獨特的生物活性。
基金：上海市農口青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-11號]、上海市農口青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-10號]項目資助；
關鍵詞：南方靈芝; 理論預測; 結構特征; 免疫調節(jié)蛋白;