【作者】肖冬來 馬璐 應正河 江曉凌 林衍銓
【機構】福建省農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所
摘要:利用同位素標記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)標記結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(two-dimensional liquid chromatography tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技術,研究廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)原基期、幼菇期和成熟子實體階段的差異表達蛋白質(zhì)組。采用Q-Exactive質(zhì)譜鑒定并經(jīng)ProteinPilot軟件搜庫,對所獲得的差異蛋白進行GO(gene ontology)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)和轉(zhuǎn)錄因子注釋分析。結(jié)果共鑒定到可信蛋白2305個,其中2219個蛋白具有相對定量信息。與原基期相比,幼菇期顯著上調(diào)蛋白104個,下調(diào)蛋白142個,子實體階段顯著上調(diào)蛋白155個,下調(diào)蛋白460個。GO分子功能提示這些差異性蛋白主要參與催化活性、蛋白結(jié)合和水解酶活性。KEGG代謝通路分析結(jié)果顯示,差異蛋白主要涉及碳代謝、氨基酸合成、核糖...
基金:福建省屬公益類科研院所基本科研專項(2014R1020-1); 福建省種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程項目(2014S1477-8)資助;
關鍵詞:廣葉繡球菌; 蛋白質(zhì)組; iTRAQ; 二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜;
【機構】福建省農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所
摘要:利用同位素標記相對和絕對定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)標記結(jié)合二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(two-dimensional liquid chromatography tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技術,研究廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)原基期、幼菇期和成熟子實體階段的差異表達蛋白質(zhì)組。采用Q-Exactive質(zhì)譜鑒定并經(jīng)ProteinPilot軟件搜庫,對所獲得的差異蛋白進行GO(gene ontology)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)和轉(zhuǎn)錄因子注釋分析。結(jié)果共鑒定到可信蛋白2305個,其中2219個蛋白具有相對定量信息。與原基期相比,幼菇期顯著上調(diào)蛋白104個,下調(diào)蛋白142個,子實體階段顯著上調(diào)蛋白155個,下調(diào)蛋白460個。GO分子功能提示這些差異性蛋白主要參與催化活性、蛋白結(jié)合和水解酶活性。KEGG代謝通路分析結(jié)果顯示,差異蛋白主要涉及碳代謝、氨基酸合成、核糖...
基金:福建省屬公益類科研院所基本科研專項(2014R1020-1); 福建省種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程項目(2014S1477-8)資助;
關鍵詞:廣葉繡球菌; 蛋白質(zhì)組; iTRAQ; 二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜;