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    比較形態(tài)學(xué)、聚丙酰胺凝膠電泳與二代測序在AM真菌群落研究中的應(yīng)用


    【發(fā)布日期】:2019-01-26  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】成斌 許偉 胡從從 賀學(xué)禮 趙麗莉
    【機構(gòu)】河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院蘭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
    摘要:采集內(nèi)蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根圍土樣,采用形態(tài)學(xué)方法、聚丙酰胺凝膠電泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技術(shù)和二代測序(next generation sequencing,NGS)技術(shù)分析羊柴根圍AM真菌群落組成和多樣性。結(jié)果表明,應(yīng)用NGS共鑒定AM真菌3綱4目10科18屬,DGGE鑒定2綱2目2科5屬,形態(tài)學(xué)鑒定1綱2目2科3屬。AM真菌分類等級越低,NGS、DGGE和形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果差異越大,尤其在屬水平上差異顯著。與NGS技術(shù)相比,形態(tài)學(xué)和DGGE方法所反映AM真菌種類主要為優(yōu)勢菌種,顯著低估了AM真菌物種組成并高估其豐度,分子測序是對形態(tài)學(xué)分類的補充和完善。 
     
    基金:國家自然科學(xué)基金(31270460,31470533); 河北省自然科學(xué)基金(C2014201060)~~;
     
    關(guān)鍵詞:AM真菌; 形態(tài)學(xué)方法; 二代測序; 群落結(jié)構(gòu)和多樣性; 荒漠生境;
     
     
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