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    石斛內(nèi)生炭角菌DNA提取方法優(yōu)化及分子鑒定


    【發(fā)布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】鐘志敏 賴小平 黃松 張桂芳
    【機(jī)構(gòu)】廣州中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥數(shù)理工程研究院 廣東省中藥新藥研發(fā)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
    摘要:本文對石斛內(nèi)生炭角菌DNA提取方法進(jìn)行優(yōu)化,并基于ITS序列及其ITS2二級結(jié)構(gòu)對其進(jìn)行分子鑒定。比較試劑盒法及不同濃度(2%、3%、4%)CTAB法的DNA提取效果并對CTAB法進(jìn)行優(yōu)化;進(jìn)行ITS序列的擴(kuò)增及ITS2二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測。結(jié)果表明:4%的CTAB提取效果最佳,優(yōu)化的CTAB法大大縮短了DNA提取時(shí)間;ITS序列與炭角菌屬3個(gè)種的相似度均為99%,ITS2二級結(jié)構(gòu)僅與Xylaria arbuscula的二級結(jié)構(gòu)100%相似。本研究所優(yōu)化的CTAB法能為后續(xù)相關(guān)研究提供便利;結(jié)合ITS序列及ITS2二級結(jié)構(gòu)能對石斛內(nèi)生炭角菌進(jìn)行準(zhǔn)確的分子鑒定。 
     
    基金:港澳臺科技合作專項(xiàng)項(xiàng)目(2014DFH30010); 廣東省應(yīng)用型科技研發(fā)專項(xiàng)資金重點(diǎn)項(xiàng)目(2015B020234008)~~;
     
    關(guān)鍵詞:石斛; 炭角菌; 優(yōu)化CTAB法; 菌種鑒定;
     
     
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