【作者】李闖劉娜王鑫許笑蒙申一林邢國珍康振生鄭文明

【機(jī)構(gòu)】河南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院小麥玉米作物學(xué)國家重點實驗室河南糧食作物協(xié)同創(chuàng)新中心西北農(nóng)林科技大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點實驗室

摘要：本研究利用已測序的條形柄銹菌Puccinia striiformis f.sp.tritici基因組序列信息,結(jié)合已公布的隱匿柄銹菌Puccinia recondita f.sp.tritici和禾柄銹菌Puccinia graminis f.sp.tritici全基因組編碼蛋白序列,運用生物信息數(shù)據(jù)庫和分析軟件對其碳水化合物酶類(CAZymes)基因家族進(jìn)行了注釋和比較分析。結(jié)果表明,3種小麥銹菌共包含1 232個CAZymes編碼基因(含有1 279個模塊)。其中,條形柄銹菌具有明顯較大的CAZymes家族,3種銹菌的CAZymes具有136個同源基因;相對于隱匿柄銹菌和禾柄銹菌,條形柄銹菌的GH、GT和AA家族發(fā)生顯著擴(kuò)增,而3種銹菌的PL家族并無差異;CBM家族則表現(xiàn)為由禾柄銹菌、隱匿柄銹菌到條形柄銹菌的遞增式擴(kuò)增。通過CAZymes、細(xì)胞壁降解酶、分泌蛋白、PHI、保守基序等不同形式注釋的比較分析表明,對該基因家族而言,條形柄銹菌相對于隱匿柄銹菌和禾柄銹菌呈擴(kuò)增現(xiàn)象,隱匿柄銹菌和禾柄銹菌的家族縮減水平存在差異。小麥銹菌CAZymes家族整體呈現(xiàn)的不同形式擴(kuò)增或縮減現(xiàn)象,可能反... 更多

 

基金：國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(2013CB127702)； 河南省科技創(chuàng)新杰出人才計劃(154200510024)； 河南省重大科技專項(161100110400)~~；

 

關(guān)鍵詞：小麥銹菌; 碳水化合物酶類; 基因家族; 生物信息學(xué)分析; 致病性變異;