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    基于全基因組數(shù)據(jù)解析傘菌目木質(zhì)纖維素降解酶系的差異


    【發(fā)布日期】:2019-01-24  【來(lái)源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】楊瑞恒李燕唐利華李傳華鮑大鵬
    【機(jī)構(gòu)】國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
    摘要:傘菌目Agaricales隸屬于擔(dān)子菌門(mén)Basidiomycota、傘菌亞門(mén)Agaricomycotina,是擔(dān)子菌門(mén)中最大的一個(gè)類(lèi)群,能夠以腐生、寄生以及共生的模式在自然環(huán)境中生存,生存范圍廣,對(duì)于維持生態(tài)環(huán)境的平衡具有重要的作用。本研究基于51株傘菌目真菌基因組大數(shù)據(jù)挖掘降解木質(zhì)纖維素相關(guān)的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)和氧化還原酶(oxidoreductases),同時(shí)比較白腐菌、褐腐菌、腐生菌、菌根菌、植物致病菌、兼性寄生菌、動(dòng)物共生菌和不明生態(tài)型真菌降解機(jī)制的差異。結(jié)果顯示白腐菌和褐腐菌等木腐菌、菌根菌、兼性寄生菌、其他腐生菌、植物致病菌以及共生菌的CAZymes家族平均數(shù)目為134個(gè)、93個(gè)、101個(gè)、127個(gè)、61個(gè)和32個(gè),而CAZymes同源的基因平均數(shù)目為398個(gè)、240個(gè)、463個(gè)、407個(gè)、418個(gè)、131個(gè)和38個(gè),木腐菌的CAZymes家族最為豐富,但是兼性寄生菌基因數(shù)目最多;同時(shí)具有木質(zhì)纖維素降解酶活性的26個(gè)家族中,基因數(shù)目分別為86個(gè)、32個(gè)、101個(gè)、86個(gè)、104個(gè)、36個(gè)和10個(gè)。在木腐... 更多
     
    基金:上海市科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目[滬農(nóng)科攻字(2016)第6-1-3號(hào); 滬農(nóng)科攻字(2015)第6-2-1; 滬農(nóng)科攻字(2014)第7-1-6]; 上海市市級(jí)農(nóng)口系統(tǒng)青年人才成長(zhǎng)計(jì)劃[滬農(nóng)青字(2015)第1-9號(hào)]; 國(guó)家食用菌工程研究中心(16DZ2281300)~~;
     
    關(guān)鍵詞:基因組規(guī)模; 傘菌目; 碳水化合物活性酶; 氧化還原酶;
     
     
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