【作者】王玉臣譚玉梅陳麗劉建魁劉永翔劉作易

【機構(gòu)】貴州省生物技術(shù)研究所貴州省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室貴州師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院

【摘要】本研究以赤散囊菌Eurotium rubrum全基因組序列為對象,利用HMMER軟件構(gòu)建隱馬爾可夫模型(hidden markov models,HMM)結(jié)合BLAST的方法鑒定了促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)超家族。通過構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹對鑒定蛋白進(jìn)行分析,并利用MEME軟件進(jìn)行了保守性基序的預(yù)測及活性位點注釋。分析結(jié)果表明,赤散囊菌基因組包含了4個MAPK蛋白,分別屬于Hog1-type、Mpk C-type、Slt2-type和Fus3/Kss1-type類型;3個MAPK kinase(MAPKK)蛋白,分別屬于MKK1-type、Pbs2-type和Ste7-type類型;3個MAPK kinase kinase(MAPKKK)蛋白,分別屬于BCK1-type、Ste11-type和Ssk22-type類型。保守性基序分析及注釋結(jié)果表明,MAPKs超家族蛋白都包含了蛋白激酶活性位點"-D[L/I/V]K-"以及保守性的ATP-binding標(biāo)簽序列。MAPK與MAPKK蛋白分別包含了"-Tx Y-"和"-SD[I/V]WS-"磷酸化位點,且MAPK蛋白還包含一個保守性的common docking基序(CD motif),而MAPKKK蛋白則包含了一個功能不明的保守性基序,其一致性序列為"-GTPYWMAPEV-"。研究結(jié)果為揭示MAPKs信號途徑在赤散囊菌中參與調(diào)控的生物學(xué)過程奠定了基礎(chǔ)。

【基金】貴州省科學(xué)技術(shù)基金(黔科合LH字[2014]7693,[2014]7688)； 黔農(nóng)科院自主創(chuàng)新專項([2014]004,[2011]037)~~；

【關(guān)鍵詞】赤散囊菌; 促分裂原活化蛋白激酶(MAPK); MAPK激酶(MAPKK); MAPK激酶激酶(MAPKKK);