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    食(藥)用真菌比較基因組分析揭示其生態(tài)特性


    【發(fā)布日期】:2019-01-22  【來(lái)源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】吳冰 章小靈 崔寶凱 戴玉成
    【機(jī)構(gòu)】北京林業(yè)大學(xué)微生物研究所 中國(guó)科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
    摘要:食(藥)用真菌可以產(chǎn)生多種酶系家族來(lái)降解環(huán)境中的木質(zhì)纖維素,從而獲得營(yíng)養(yǎng)或與植物共生或寄生。通過(guò)注釋和比較不同營(yíng)養(yǎng)模式的食(藥)用真菌中降解木質(zhì)纖維素的酶類(lèi),有利于我們更好地認(rèn)識(shí)食(藥)用真菌的生活模式,并進(jìn)一步改善培養(yǎng)條件。本文系統(tǒng)地研究了46個(gè)食(藥)用真菌和3個(gè)降解木質(zhì)纖維素模式真菌的基因組,根據(jù)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)組解析了糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)、糖基轉(zhuǎn)移酶(glycosyltransferases,GTs)、多糖裂解酶(polysaccharide lyases,PLs)、碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,CEs)、碳水化合物結(jié)合模塊(carbohydrate-binding modules,CBMs)以及附屬活力酶(auxiliary activities,AAs)和細(xì)胞色素P450(cytochromes P450)的種類(lèi)分布。比較基因組學(xué)結(jié)果顯示,食(藥)用真菌中降解木質(zhì)纖維素相關(guān)酶系家族的數(shù)量和種類(lèi)差別很大,同時(shí)酶系家族的多樣性與食(藥)用真菌的生態(tài)類(lèi)型也有一定的相關(guān)性。一般情況下,腐生營(yíng)養(yǎng)真菌比共生營(yíng)養(yǎng)真菌中降解木質(zhì)纖維素酶類(lèi)更多,而腐生營(yíng)養(yǎng)中的白腐真菌和草腐真菌的酶系比褐腐真菌多。
    基金:國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)課題(2014CB138301);
    關(guān)鍵詞:食用菌; 藥用菌; 木質(zhì)纖維素; 木質(zhì)素;
     
     
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