【作者】陳仁良 嚴俊杰 陶永新 謝斌 張磊 吳塔菊 李少杰 謝寶貴
【機構】福建農林大學生命科學學院菌物研究中心 福建農林大學園藝學院 中國科學院微生物研究所
摘要：真核翻譯起始因子IF4E(initiation factor 4E)可通過與m RNA的5’帽子端結合,在蛋白質的翻譯起始過程中扮演重要角色。草菇Volvariella volvacea是一種富有商業(yè)價值的食用真菌,其生長發(fā)育與蛋白質的合成代謝密切相關。本文通過鑒定草菇編碼IF4E的基因(Vv-IF4E),并根據(jù)生物信息學和實時熒光定量數(shù)據(jù)分析Vv-IF4E及相關轉錄因子基因表達量的變化規(guī)律。結果顯示,草菇Vv-IF4E基因上游存在較多順式作用元件,基因存在4種可變剪切體,只有一種具有翻譯起始因子的保守結構域。預測開放閱讀框(ORF)長度為3 083bp,所編碼蛋白分子量為87.1k Da,存在35個磷酸化位點。Vv-IF4E蛋白結構有異于擬南芥IF4E,但與皺木耳Auricularia delicata IF4E相似。實時熒光定量結果表明,Vv-IF4E與轉錄因子YRR1、ECM22存在極強的共表達規(guī)律。
基金：國家重點基礎研究發(fā)展計劃(973計劃)(2014CB138302)； 國家現(xiàn)代農業(yè)產業(yè)技術體系建設專項資金(CARS24)*；
關鍵詞：草菇; 蛋白質合成; 熒光定量PCR; 共表達; 皮爾森相關系數(shù);