【作者】曲積彬 張金霞 陳強 黃晨陽
【機構(gòu)】中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所
【摘要】從已公布的糙皮側(cè)耳基因組信息入手,用全局比對法計算兩個不同單核之間基因序列的相似性,這種相似性與基因序列的保守性有關(guān)。通過對保守和不保守的基因集合進行功能富集分析研究,分析與序列保守性相關(guān)的Gene Ontology功能。保守基因集合中顯著富集的主要是一些代謝過程、催化酶活性、輸送等功能。不保守基因集合中顯著富集的多為激酶活性、綁定、調(diào)控等功能。
【基金】國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(No.2014CB138303)； 國家科技支撐計劃課題:食用菌新品種培育及制種關(guān)鍵技術(shù)研究(No.2013BAD16B02)；
【關(guān)鍵詞】基因組; 全局比對; 基因本體論; 功能富集分析;