【作者】代永東 虞泓 陳自宏 楊俊媛
【機(jī)構(gòu)】云南大學(xué)中草藥生物資源研究所云百草實(shí)驗(yàn)室
【摘要】對云南粉棒束孢8個當(dāng)?shù)鼐尤汉万鸲陻M青霉2個當(dāng)?shù)鼐尤哼M(jìn)行ITS測序和RAPD擴(kuò)增分析,結(jié)合Gen Bank中相關(guān)序列,對粉棒束孢開展遺傳多樣性、居群遺傳結(jié)構(gòu)及其種內(nèi)分化研究。共獲得大范圍內(nèi)地理距離遠(yuǎn)的6個居群共97條粉棒束孢ITS序列,共有33種單倍型,單倍型多樣性Hd=0.546和總核苷酸多樣性Pi=0.00276,顯示粉棒束孢在物種水平上遺傳多樣性較低。云南粉棒束孢共37條序列,有14種單倍型(10種為云南特有),具有較高單倍型多樣性和核苷酸多樣性(Hd=0.659,Pi=0.00274);單倍型聚類和網(wǎng)狀分支分析表明云南粉棒束孢單倍型類型豐富,遺傳多樣性高,暗示云南為粉棒束孢多樣性分布中心之一。ITS序列分析表明,云南當(dāng)?shù)鼐尤洪g遺傳分化系數(shù)Fst=51.95%;RAPD分析表明,居群間遺傳分化系數(shù)Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;說明云南當(dāng)?shù)鼐尤悍郯羰叻只瘎×?。居群遺傳距離與地理距離相關(guān)性研究表明,粉棒束孢居群遺傳距離與地理距離無明顯相關(guān)。中性檢驗(yàn)和失配分析表明粉棒束孢經(jīng)歷過近期居群擴(kuò)張。結(jié)合單倍型聚類和網(wǎng)狀分支分析,表明Hap 19為擴(kuò)張建群單倍型,但原始祖先單倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最優(yōu)勢單倍型(頻率為48.45%),表明粉棒束孢并不存在明顯的因地理原因造成的生殖隔離。值得重視的是,通過ITS單倍型和RAPD分析,支持將蝙蝠蛾擬青霉作為粉棒束孢異名處理。
【基金】國家教育部博士點(diǎn)基金項目《冬蟲夏草復(fù)合體居群DNA序列生態(tài)地理變異式樣研究》(20125301110001); 國家火炬計劃產(chǎn)業(yè)化示范項目《云南云百草牌蟲草系列產(chǎn)品產(chǎn)業(yè)化》(2013GH021540); 云南省科技計劃民營經(jīng)濟(jì)發(fā)展專項資金項目《云南蟲草生物資源可持續(xù)產(chǎn)業(yè)化開發(fā)》(2014XA051);
【關(guān)鍵詞】ITS序列分析; RAPD擴(kuò)增分析; 單倍型; 居群擴(kuò)張; 相關(guān)性;
【機(jī)構(gòu)】云南大學(xué)中草藥生物資源研究所云百草實(shí)驗(yàn)室
【摘要】對云南粉棒束孢8個當(dāng)?shù)鼐尤汉万鸲陻M青霉2個當(dāng)?shù)鼐尤哼M(jìn)行ITS測序和RAPD擴(kuò)增分析,結(jié)合Gen Bank中相關(guān)序列,對粉棒束孢開展遺傳多樣性、居群遺傳結(jié)構(gòu)及其種內(nèi)分化研究。共獲得大范圍內(nèi)地理距離遠(yuǎn)的6個居群共97條粉棒束孢ITS序列,共有33種單倍型,單倍型多樣性Hd=0.546和總核苷酸多樣性Pi=0.00276,顯示粉棒束孢在物種水平上遺傳多樣性較低。云南粉棒束孢共37條序列,有14種單倍型(10種為云南特有),具有較高單倍型多樣性和核苷酸多樣性(Hd=0.659,Pi=0.00274);單倍型聚類和網(wǎng)狀分支分析表明云南粉棒束孢單倍型類型豐富,遺傳多樣性高,暗示云南為粉棒束孢多樣性分布中心之一。ITS序列分析表明,云南當(dāng)?shù)鼐尤洪g遺傳分化系數(shù)Fst=51.95%;RAPD分析表明,居群間遺傳分化系數(shù)Gst=0.5547,基因流Nm=0.4014;說明云南當(dāng)?shù)鼐尤悍郯羰叻只瘎×?。居群遺傳距離與地理距離相關(guān)性研究表明,粉棒束孢居群遺傳距離與地理距離無明顯相關(guān)。中性檢驗(yàn)和失配分析表明粉棒束孢經(jīng)歷過近期居群擴(kuò)張。結(jié)合單倍型聚類和網(wǎng)狀分支分析,表明Hap 19為擴(kuò)張建群單倍型,但原始祖先單倍型(Hap 1)依然是粉棒束孢居群中最優(yōu)勢單倍型(頻率為48.45%),表明粉棒束孢并不存在明顯的因地理原因造成的生殖隔離。值得重視的是,通過ITS單倍型和RAPD分析,支持將蝙蝠蛾擬青霉作為粉棒束孢異名處理。
【基金】國家教育部博士點(diǎn)基金項目《冬蟲夏草復(fù)合體居群DNA序列生態(tài)地理變異式樣研究》(20125301110001); 國家火炬計劃產(chǎn)業(yè)化示范項目《云南云百草牌蟲草系列產(chǎn)品產(chǎn)業(yè)化》(2013GH021540); 云南省科技計劃民營經(jīng)濟(jì)發(fā)展專項資金項目《云南蟲草生物資源可持續(xù)產(chǎn)業(yè)化開發(fā)》(2014XA051);
【關(guān)鍵詞】ITS序列分析; RAPD擴(kuò)增分析; 單倍型; 居群擴(kuò)張; 相關(guān)性;