【作者】趙彥玲 鄭世學 方治偉 喻子牛
【機構】華華中農(nóng)業(yè)大學農(nóng)業(yè)微生物學國家重點實驗室微生物農(nóng)藥國家工程研究中心
摘要:湖泊沉積物中真菌的類群及其作用所知甚少。以長江中上游代表性湖泊洪湖為研究對象,從湖心截取了一個72cm長的沉積柱,通過rDNA內(nèi)轉錄間隔區(qū)(ITS)的變性梯度凝膠電泳(DGGE),對洪湖沉積物中真菌群落結構的垂直變化進行了分析。結果顯示,DGGE條帶以14-18cm層次為過渡,在2-14cm和14-72cm之間存在一定差異。Shannon-Weaverindex(H′)在上下層之間有波動。聚類分析上層2-18cm和中下層18-72cm分別以不同的小類聚在一起。表明14-18cm以上和以下的類群存在差異,即隨深度增加真菌群落結構有明顯變化。真菌主要類群屬于子囊菌門Ascomycota和擔子菌門Basidiomycota。子囊菌門是真菌的主導類群,占所有類群總量的70%。子囊菌門包括酵母菌亞門Saccharomycotina和盤菌亞門Pezizomycotina;擔子菌門包括異擔子菌綱Heterobasidiomycetes,黑粉菌綱Ustilaginomycetes和未分類的擔子菌unclassified Basidiomycota。
基金:中央高校基本科研業(yè)務費專項資金(No.2009PY013);
關鍵詞:內(nèi)轉錄間隔區(qū)(ITS); 變性梯度凝膠電泳(DGGE); 子囊菌門; 擔子菌門;
【機構】華華中農(nóng)業(yè)大學農(nóng)業(yè)微生物學國家重點實驗室微生物農(nóng)藥國家工程研究中心
摘要:湖泊沉積物中真菌的類群及其作用所知甚少。以長江中上游代表性湖泊洪湖為研究對象,從湖心截取了一個72cm長的沉積柱,通過rDNA內(nèi)轉錄間隔區(qū)(ITS)的變性梯度凝膠電泳(DGGE),對洪湖沉積物中真菌群落結構的垂直變化進行了分析。結果顯示,DGGE條帶以14-18cm層次為過渡,在2-14cm和14-72cm之間存在一定差異。Shannon-Weaverindex(H′)在上下層之間有波動。聚類分析上層2-18cm和中下層18-72cm分別以不同的小類聚在一起。表明14-18cm以上和以下的類群存在差異,即隨深度增加真菌群落結構有明顯變化。真菌主要類群屬于子囊菌門Ascomycota和擔子菌門Basidiomycota。子囊菌門是真菌的主導類群,占所有類群總量的70%。子囊菌門包括酵母菌亞門Saccharomycotina和盤菌亞門Pezizomycotina;擔子菌門包括異擔子菌綱Heterobasidiomycetes,黑粉菌綱Ustilaginomycetes和未分類的擔子菌unclassified Basidiomycota。
基金:中央高校基本科研業(yè)務費專項資金(No.2009PY013);
關鍵詞:內(nèi)轉錄間隔區(qū)(ITS); 變性梯度凝膠電泳(DGGE); 子囊菌門; 擔子菌門;