作者:蔡柏巖 葛菁萍 接偉光 閻秀峰
機構:黑龍江大學生命科學學院 黑龍江省普通高等學校微生物重點實驗室 黑龍江東方學院食品與環(huán)境工程學部 東北林業(yè)大學生命科學學院
摘要:從東北林業(yè)大學林場采集黃檗Phellodendron amurense根系及根圍土壤,采用Nested-PCR技術擴增黃檗菌根及根圍土壤AM真菌18SrDNA NS31/Glol區(qū)域,利用該產(chǎn)物進行DGGE分析,并結合DNA測序、系統(tǒng)發(fā)育分析及DGGE圖譜分析技術對黃檗AM真菌菌群組成進行分析。結果表明:Nested-PCR技術具有較高的靈敏性,可有效地從微量DNA中擴增出約230bp的目的片段;黃檗根系及根圍土壤具有不同的DGGE指紋圖譜特征,DGGE帶譜在條帶的數(shù)量、亮度、優(yōu)勢度等方面均存在較大差異,全部序列可分為3類菌群,即球囊霉屬Glomus、盾孢囊霉屬Scutellospora及植物病原菌黃楊亞赤殼Hyponectria buxi,其中Glomus sp.(EF177624)和Glomus sp.(DQ085205)分別為黃檗根系和根圍土壤樣品中最具優(yōu)勢的AM真菌。
基金:黑龍江省博士后基金(No.LBH-Z05013); 黑龍江大學博士啟動基金;
關鍵詞:18SrDNA; Nested-PCR技術; 變性梯度凝膠電泳; 系統(tǒng)發(fā)育分析;
機構:黑龍江大學生命科學學院 黑龍江省普通高等學校微生物重點實驗室 黑龍江東方學院食品與環(huán)境工程學部 東北林業(yè)大學生命科學學院
摘要:從東北林業(yè)大學林場采集黃檗Phellodendron amurense根系及根圍土壤,采用Nested-PCR技術擴增黃檗菌根及根圍土壤AM真菌18SrDNA NS31/Glol區(qū)域,利用該產(chǎn)物進行DGGE分析,并結合DNA測序、系統(tǒng)發(fā)育分析及DGGE圖譜分析技術對黃檗AM真菌菌群組成進行分析。結果表明:Nested-PCR技術具有較高的靈敏性,可有效地從微量DNA中擴增出約230bp的目的片段;黃檗根系及根圍土壤具有不同的DGGE指紋圖譜特征,DGGE帶譜在條帶的數(shù)量、亮度、優(yōu)勢度等方面均存在較大差異,全部序列可分為3類菌群,即球囊霉屬Glomus、盾孢囊霉屬Scutellospora及植物病原菌黃楊亞赤殼Hyponectria buxi,其中Glomus sp.(EF177624)和Glomus sp.(DQ085205)分別為黃檗根系和根圍土壤樣品中最具優(yōu)勢的AM真菌。
基金:黑龍江省博士后基金(No.LBH-Z05013); 黑龍江大學博士啟動基金;
關鍵詞:18SrDNA; Nested-PCR技術; 變性梯度凝膠電泳; 系統(tǒng)發(fā)育分析;