【作者】肖長坤 鄭建秋 李健強 師迎春 Hasan Bolkan

【機構(gòu)】北京市植物保護站 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院植物病理系中國農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院植物病理系 北京100029北京100019 北京100019Campbell Researchand Development Campbell Soup CompanyDavisCA95616USA.

【摘要】本文以來自國內(nèi)外的20株白菜黑斑病菌及近源種為研究材料,進行了5.8SrDNA及其側(cè)翼ITS區(qū)的克隆、測序、序列變異及遺傳進化關(guān)系分析。黑斑病菌及其近源種真菌核糖體5.8SrDNA及其側(cè)翼ITS區(qū)序列比對結(jié)果顯示,不同種菌株ITS1比ITS2在堿基構(gòu)成上有更大變異,而且ITS1的序列長度變異比ITS2的大;而種內(nèi)雖然各菌株的寄主和地理來源不同,但ITS1和ITS2在長度上均沒有變異,堿基構(gòu)成上存在微小的變異。對該區(qū)序列的聚類分析表明,白菜黑斑病菌3個種蕓薹鏈格孢Alternariabrassicae、甘藍鏈格孢A.brassicicola和蘿卜鏈格孢A.japonica雖然地理來源和寄主不同,但種內(nèi)的不同菌株均在一個獨立的聚類組中,種之間以及其和鏈格孢屬內(nèi)其它種在聚類關(guān)系上能明顯分開,可基于該區(qū)進行黑斑病菌的分類鑒定。 

【基金】國家“十五”科技攻關(guān)計劃專題項目(編號2002BA516A08-11)部分內(nèi)容；

【關(guān)鍵詞】聚類分析; 分類鑒定; A.brassicae; A.brassicicola; A.japonica;

黑斑病菌及其近源種 5.8S rDNA 側(cè)翼 ITS1 聚類分析樹狀圖

黑斑病菌及其近源種 5.8S rDNA 側(cè)翼 ITS2 聚類分析樹狀圖