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    大豆疫霉和苜蓿疫霉rDNA ITS序列分析


    【發(fā)布日期】:2018-01-29  【來(lái)源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】張正光 王源超 鄭小波
    【機(jī)構(gòu)】南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植保學(xué)院農(nóng)業(yè)部病蟲(chóng)監(jiān)測(cè)與治理重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植保學(xué)院農(nóng)業(yè)部病蟲(chóng)監(jiān)測(cè)與治理重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室 南京210095
    【摘要】采用真菌核糖體基因轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)通用引物,PCR分別擴(kuò)增了Phytophthora sojae的5個(gè)菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1個(gè)P. medicaginis (菌株44390)的ITS1與ITS2,并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行了序列測(cè)定。根據(jù)Bioedit軟件中的neighbour-joining methods分析法將上述序列和Genbank中已登錄的P. sojae、P. medicaginis、P. megasperma和P.trifolii等4個(gè)形態(tài)學(xué)種10個(gè)登錄菌株的ITS1與ITS2堿基序列進(jìn)行聚類分析。結(jié)果是聚類組與形態(tài)學(xué)種有一定差別,4個(gè)種16個(gè)菌株分成7個(gè)聚類組。結(jié)果表明,分別屬于同一形態(tài)學(xué)種且可聚為一組的不同個(gè)體之間的ITS堿基序列遺傳相似性最高,但是也具有一定的多樣性;形態(tài)學(xué)上屬于不同種的個(gè)體的ITS可以聚為一組。上述結(jié)果提示L41385可能不屬于P. sojae, L41380可能屬于是P. trifolii,P. megasperma仍是一個(gè)復(fù)合種。同時(shí)提示ITS DNA堿基序列可以區(qū)分形態(tài)學(xué)種。 
    【基金】國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)(2002CB111402); 國(guó)家自然科學(xué)基金(30270055); 國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(2001AA249021);
    【關(guān)鍵詞】Phytophthoramegasperma; P.trifolii; 形態(tài)學(xué)種; 聚類組;Phytophthoramegasperma; P.trifolii; 形態(tài)學(xué)種; 聚類組;
     
     
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