【作者】 杜慕云； 楊仁德； 李劍； 謝寶貴； 

 

【Author】 DU Muyun;YANG Rende;LI Jian;XIE Baogui;Guizhou Soil and Fertilizer Institute;Mycological Research Center of Fujian Agricultural and Forestry University;

 

【機構】 貴州省土壤肥料研究所； 福建農(nóng)林大學菌物研究中心； 

 

【摘要】 基于草菇(Volvariella volvacea)基因組和轉錄組數(shù)據(jù),通過生物信息學的方法對草菇α-淀粉酶基因進行基本理化性質、內含子和外顯子結構、信號肽、亞細胞定位和功能位點的預測與分析,并構建系統(tǒng)發(fā)育樹。結果表明:編碼草菇α-淀粉酶的基因有5個,分別為GME2151、GME6695、GME9075、GME10698和GME10705;5個基因編碼的蛋白相對分子量介于38.8~64.6kD之間,磷酸化以Ser位點為主,大都存在信號肽,亞細胞定位在細胞外,保守結構域和空間結構相似度較高。和其它的擔子菌一樣,草菇α-淀粉酶可以分為兩類:GME9075和GME10698歸為α-淀粉酶Ⅰ類,GME2151、GME6695和GME10705屬于α-淀粉酶Ⅱ類。 更多還原

 

【關鍵詞】 草菇； α-淀粉酶基因； 生物信息學； 

【文內圖片】

【基金】 草菇育種崗位(編號:CARS 24);黔科合體(編號:Z字2013-4006號)的部分研究內容