【作者】 劉芳； 王威； 謝寶貴； 

 

【Author】 LIU Fang;WANG Wei;XIE Baogui;Mycological Research Center of Fujian Agriculture and Forestry University;

 

【機(jī)構(gòu)】 福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心； 

 

【摘要】 以金針菇(Flammulina velutipes)1123菌株的單孢W23基因組為參考完成其菌絲和原基轉(zhuǎn)錄組測序與數(shù)據(jù)分析,研究兩樣本間差異基因,并對差異基因進(jìn)行GO功能和KEGG Pathway顯著性富集分析。結(jié)果表明:兩個樣本中共有顯著性差異表達(dá)的基因3310個,其中在原基中上調(diào)、下調(diào)的基因數(shù)分別為1686、1624個,只在原基中表達(dá)的基因有26個。GO功能分析結(jié)果表明,在原基中膜封閉腔、內(nèi)膜系統(tǒng)、細(xì)胞器腔、核糖核蛋白復(fù)合體、翻譯調(diào)節(jié)器、發(fā)育過程、免疫系統(tǒng)過程、多細(xì)胞生物過程這8個GO基本單元中的差異基因全部呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá)。Pathway功能富集分析結(jié)果表明,核糖體與DNA復(fù)制中的差異基因全部呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá),糖酵解途徑中從D-葡萄糖轉(zhuǎn)化成丙酮酸過程相關(guān)的11個差異基因全部呈下調(diào)表達(dá),磷酸戊糖途徑中相關(guān)的13個差異基因中有11個基因呈下調(diào)表達(dá)。 更多還原

 

【關(guān)鍵詞】 原基； 差異基因表達(dá)； GO功能； Pathway分析； 

【文內(nèi)圖片】

【基金】 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(編號:CARS24);973計劃項(xiàng)目(編號:2014CB138302)基金資助