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    杏鮑菇漆酶基因DNA片段的克隆及序列分析


    【發(fā)布日期】:2014-02-28
      【作者】 薛丹; 郭九峰; 那日; 劉騰; 
     
      【機(jī)構(gòu)】 內(nèi)蒙古大學(xué)自治區(qū)離子束生物工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 
     
      【摘要】 參照Genbank中發(fā)表的杏鮑菇漆酶基因序列(No.AY686700),并根據(jù)真菌漆酶氨基酸序列保守區(qū)設(shè)計(jì)特異性引物。以杏鮑菇基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增出長(zhǎng)2 606 bp的漆酶基因片段,DNA經(jīng)純化后克隆到pGM-T載體上,經(jīng)篩選、PCR鑒定和序列分析,證明該片段為完整的杏鮑菇漆酶基因(Genbank注冊(cè)號(hào)KC789846)。通過對(duì)基因序列的內(nèi)含子/外顯子進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,獲得漆酶編碼區(qū)的cDNA,該基因的開放閱讀框由1 596個(gè)核苷酸組成,編碼一個(gè)由531個(gè)氨基酸組成的多肽,分子量大小約為56 682.0,等電點(diǎn)pI為4.56;比對(duì)結(jié)果發(fā)現(xiàn)該基因氨基酸序列與其他真菌漆酶的同源性最高達(dá)93%;進(jìn)一步對(duì)X22-12漆酶二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,并通過SWISS-MODEL預(yù)測(cè)了該酶的三維結(jié)構(gòu)。 
     
      【關(guān)鍵詞】 杏鮑菇; 漆酶基因; 基因克隆; 序列分析; 
     
      【基金】 國(guó)家自然科學(xué)基金(No.51267014)
     
      【分類號(hào)】S646 
     
     
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