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  • 松乳菇ITS序列比較及其在乳菇屬中的系統(tǒng)發(fā)育分析


    【發(fā)布日期】:2013-10-15
     【作者】 陳玉華; 劉君昂; 周國(guó)英; 李河; 王圣潔; 路宗巖; 
     
    【Author】 CHEN Yuhua2,LIU Jun’ang1,2,ZHOU Guoying1,2*,LI He1,2, WANG Shengjie2,LU Zongyan2 1Key Laboratory for Non-wood Forest Cultivation and Conservation of the Ministry of Education,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004,China;2College of Forestry,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004,China
     
    【機(jī)構(gòu)】 中南林業(yè)科技大學(xué)林學(xué)院; 經(jīng)濟(jì)林培育與保護(hù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中南林業(yè)科技大學(xué); 
     
    【摘要】 提取江蘇、云南、江西、湖南、廣西、安徽、湖北地區(qū)的松乳菇(Lactarius deliciosus)、紅汁乳菇(L.hatsudake)、橙色乳菇(L.akahatsu)和鮭色乳菇(L.salmonicolor)共25個(gè)子實(shí)體樣本的基因組DNA,擴(kuò)增ITS序列,對(duì)GenBank下載和本次及以前測(cè)序的松乳菇ITS序列的堿基組成、變異位點(diǎn)及堿基替換類型進(jìn)行分析,從GenBank下載乳菇屬其它8個(gè)種,構(gòu)建乳菇系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示:松乳菇ITS序列共有20 bp長(zhǎng)度的變化,堿基C、T含量大于G、A含量。變異位點(diǎn)ITS共有99個(gè)(ITS1 58個(gè)、5.8S 4個(gè)、ITS2 37個(gè)),其中主要是T與C的轉(zhuǎn)換,轉(zhuǎn)換與顛換位點(diǎn)數(shù)分別為8和5。ITS1、5.8S、ITS2中轉(zhuǎn)換與顛換的比值R分別為2.34、1.95、1.12?;贗TS序列計(jì)算不同地區(qū)松乳菇間的遺傳距離,江西與意大利、西班牙,法國(guó)與西班牙序列間的遺傳距離最大為0.012,云南和法國(guó)序列間遺傳距離為0,是同源序列。系統(tǒng)發(fā)育樹顯示:松乳菇和紅汁乳菇、橙色乳菇親緣關(guān)系較近。
     
    【關(guān)鍵詞】 松乳菇; ITS序列; 系統(tǒng)發(fā)育; 
     
    【基金】 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(編號(hào):30972371)的部分研究?jī)?nèi)容
     
    【分類號(hào)】S646
     
     
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