橙黃乳菇遺傳多樣性分析
Genetic Diversity of Lactarius akahatsu from China and Thailand
【作者】 李河; 徐建平; 郭亮; 劉君昂; 周國英; 朱丹雪;
【Author】 LI He1,2,XU Jianping1,2,GUO liang2,LIU Jun’ang1,2,ZHOU Guoying1,2,ZHU Danxue2 1Key Laboratory for Non-wood Forest Cultivation and Conservation of the Ministry of Education; Central South University of Forestry and Technology;Changsha,Hunan 410004,China; 2College of Forestry,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004;China
【機(jī)構(gòu)】 經(jīng)濟(jì)林培育與保護(hù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中南林業(yè)科技大學(xué); 中南林業(yè)科技大學(xué)林學(xué)院;
【摘要】 分析來自湖南省道縣(DX)、張家界市(ZJJ)、芷江縣(ZJ)、麻陽縣(MY)和貴州省玉屏縣(YP)以及泰國(TL)6個(gè)橙黃乳菇種群38個(gè)菌株的ITS-5.8S序列的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性。所有的ITS-5.8SrDNA序列樣品共檢測(cè)到2個(gè)變異位點(diǎn),堿基A、T、G、C的平均含量分別為22.5%、26.9%、22.7%和27.9%。根據(jù)序列的核苷酸變異共定義了3種單倍型,其中單倍型Hapolotype 3是湖南和貴州5個(gè)種群共享單倍型,Hapolotype 2為6個(gè)種群的共享單倍型。中國橙黃乳菇各地區(qū)種群的單倍型多樣性(haplotype diversity,HD)在0.21875~0.59375之間,表明橙黃乳菇種群具有較高的單倍型多樣性。遺傳分化指數(shù)(fixation index,FST)表明,不同地理種群間的遺傳分化較大。AMOVA分析顯示,種群間的遺傳變異占總變異的17%,種群內(nèi)部變異占總變異的83%。Mantel測(cè)試顯示地理距離與種群的遺傳分化FST值之間線性關(guān)系顯著(P<0.05)。采用N-J法構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹表明,當(dāng)與乳菇屬相近種進(jìn)行比較時(shí),湖南、貴州和泰國不同地區(qū)的所...
【關(guān)鍵詞】 橙黃乳菇; 地理種群; 遺傳多樣性; 遺傳分化; ITS-5.8S序列;
【文內(nèi)圖片】
植黃乳菇種群間的遺傳分化FST
值橙黃乳菇群體的Mismatch分布
基于ITSs,ss序列的r{系統(tǒng)樹
【基金】 國家自然科學(xué)基金(編號(hào):30972371)的部分研究?jī)?nèi)容
【分類號(hào)】S646