香菇重組交換在基因組中的分布特征

易菇網(wǎng)訊  12月15日，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院邊銀丙教授領(lǐng)銜的應(yīng)用真菌研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所在Journal of fungi（2020IF=5.816）上在線發(fā)表了題為“Chromosome-wide characterization of intragenic crossover in shiitake mushroom, Lentinula edodes”的研究論文，龔文兵副研究員為論文第一作者，肖揚(yáng)副教授為通訊作者。該研究首次表征了香菇重組交換特征及其熱點(diǎn)分布，并對香菇重組交換變異進(jìn)行了遺傳解析。

重組交換（crossovers，COs）是減數(shù)分裂的核心事件，亦是基因組進(jìn)化和遺傳多樣性形成的關(guān)鍵驅(qū)動力之一，是育種的基礎(chǔ)。通過遺傳作圖研究重組交換，分析COs在基因組中的分布，了解重組熱點(diǎn)形成機(jī)制，挖掘調(diào)控重組變異的遺傳位點(diǎn)，有助于開發(fā)有效方法調(diào)控重組發(fā)生，打破育種的瓶頸。本研究利用香菇 F1 單核體群體的基因型數(shù)據(jù)，在全基因組水平對香菇的重組交換進(jìn)行了表征，鑒定了884個COs，主要聚集于65個COs熱點(diǎn)區(qū)域，并分析了熱點(diǎn)區(qū)域的富集基序。隨后利用連鎖分析鑒定了調(diào)控不同類型重組交換變異的遺傳位點(diǎn)及候選基因，該結(jié)果有利于加深對大型真菌同源重組保守型與多樣性機(jī)制的認(rèn)識水平。

該成果是團(tuán)隊(duì)在香菇遺傳學(xué)研究領(lǐng)域取得的又一重要進(jìn)展。今年3月和9月，團(tuán)隊(duì)先后在Journal of Advanced Research (2020IF=10.479) ，Computational and Structural Biotechnology Journal (2020IF=7.271) 發(fā)表重要研究論文。相關(guān)研究獲得了國家自然科學(xué)基金、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和華中農(nóng)業(yè)大學(xué)自主科技創(chuàng)新基金等項(xiàng)目的資助。

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