金針菇作為我國重要的栽培食用菌之一，經濟價值和營養(yǎng)價值都很高，它的身影經常出現在餐桌上。據數據統(tǒng)計，金針菇的產量在我國食用菌中位列第四。在過去的研究中，由于形態(tài)特征類似，不少人把金針菇歸到歐洲的毛腿冬菇（Flammulina velutipes）。
近日，中科院昆明植物所真菌多樣性與分子進化研究團隊有了新的發(fā)現，他們認為金針菇和毛腿冬菇是兩個完全不同的物種。為此，研究團隊給“金針菇”起了一個學名叫“F.filiformis”。
中科院昆明植物所研究員楊祝良告訴《中國科學報》記者：“近幾年，研究組在科技部‘973’項目的支持下，開展食用菌優(yōu)異種質性狀形成的遺傳基礎研究，金針菇就是其中一個重要的研究對象。解決金針菇的物種歸屬問題，是其他一切研究的基礎。如今在團隊的努力下，金針菇終于有了自己的‘戶口身份’證明。”
從中國冬菇屬分類開始的課題
金針菇喜歡低溫，常在冬季出菇，因此它又被稱為“冬菇”?？茖W家之前通過從冬菇個體上分離得到的菌株，再經過人工馴化、雜交、選育等過程，最終培育出了現在廣泛栽培的金針菇。
過去，科研人員曾對金針菇屬的物種多樣性開展過一些研究，發(fā)現東亞的金針菇與原初描述于歐洲的毛腿冬菇存在差異。但是，由于當時研究手段有限，這個問題一直懸而未決。
楊祝良告訴記者，2005年他指導當時的博士研究生葛再偉開展了中國冬菇屬的分類研究。雖然在《真菌多樣性》期刊發(fā)表了研究結果，但成果還有局限性。
“2014年‘973’項目啟動，于是我們又將金針菇的問題提到議事日程上，葛再偉的團隊對過去沒有解決的問題繼續(xù)進行梳理。”楊祝良說。
根據當時掌握的材料，研究團隊對我國的冬菇屬標本進行了研究。他們基于形態(tài)特征及內轉錄間隔區(qū)（ITS）的核苷酸序列分析，報道了中國的一個新記錄種和兩個新變種，其中一點就是將東亞的金針菇定名為毛腿冬菇絲蓋新變種（F. velutipes var. filiformis）。不過，這只是權宜之計。
楊祝良提到，在項目研究過程中，不少科學家給予了重要支持。中國農業(yè)科學院農業(yè)資源與農業(yè)區(qū)劃研究所研究員張金霞提供了一些重要菌株，北京林業(yè)大學教授戴玉成將團隊在我國北方和在歐洲采到的標本一并贈予楊祝良團隊進行研究。
“歐洲蘑菇研究權威專家、蘇黎世工業(yè)大學教授E. Horak和芬蘭的一位同行也加入到了該研究中，奧地利維也納大學標本館和美國田納西州立大學標本館也為我們提供了幫助。大家集思廣益后，在我指導下，由博士研究生王攀蒙開展具體研究工作，我們試圖充分利用現有研究材料來闡明金針菇的分類地位。”楊祝良說。
用基因組手段挖掘種質資源
在這項長達10余年的工作中，由于種種條件缺乏，研究團隊要面臨各種各樣的困難，其中最重要的一個就是標本質量不高、國外標本缺乏。
楊祝良說：“要證明東亞的金針菇與歐洲毛腿冬菇是相同還是不同，首先必須有采自兩地的充足的標本，標本質量要高，這樣才能開展分子水平的差異研究，從統(tǒng)計學上闡述二者的異同。”
為此，2006年借國際合作研究之機，楊祝良在德國采集了歐洲毛腿冬菇的標本。在多年野外標本采集和菌種分離積累的基礎上，他們通過與國內外研究者合作和館際互借，最終得到了該屬12個物種的88份高質量標本，克服了高質量標本缺乏的困難。
同時，由于種間形態(tài)上十分相似，選擇適合的分子標記就尤為重要。研究中團隊發(fā)現，目前常用的分子標記片段并不能很好地解決“金針菇”的分類地位問題。尋求其他分子標記，例如交配型基因的差異，就成為當務之急。
“當時國內外很少有用擔子菌交配型基因的核苷酸序列來開展相關研究，因此能夠供借鑒的成果有限。我們就根據已發(fā)表的金針菇交配型基因文獻資料，對冬菇屬所包含的四種類型的交配型基因都作了相關測試。”楊祝良表示。
經過團隊的不斷摸索，他們最終篩選出了適合系統(tǒng)發(fā)育分析的交配型基因片段，為后續(xù)的真菌分類學研究提供了新的思路。
楊祝良告訴記者，研究團隊用交配型基因構建的系統(tǒng)發(fā)育樹，在認識冬菇屬物種多樣性方面很有幫助，冬菇屬的個別物種可能需要重新界定。“另外，我們系統(tǒng)地研究了冬菇屬物種的多樣性，這對資源利用和產業(yè)發(fā)展可以提供指導，為今后基于基因組、基因工程等手段精準挖掘和利用該屬種質資源提供了基礎性的科學依據。”楊祝良說。
致力真菌分類學研究
清代文學家方苞曾說過“蓋將天開以成務，必先分類而知名”，只有掌握了自然界各類生物和物體的名字，才能認識自然界并與之和諧相處。楊祝良表示，物種是生物學一切學科研究的基礎，真菌也不例外。
近年來，他帶領團隊開展真菌的多樣性、系統(tǒng)發(fā)育、生物地理及分子進化等研究工作。除了金針菇，團隊對牛肝菌科、鵝膏科及蘑菇科真菌也有較為系統(tǒng)深入的研究。他們提出了牛肝菌科內各亞科和部分屬種劃分的“形態(tài)—分子標準”，發(fā)表了牛肝菌科的4個新亞科、13個新屬和72個新種，引領了牛肝菌科真菌的精準分類。與此同時，團隊也揭示了松塔牛肝菌屬的非洲起源與全球分布格局形成機制，明晰了網蓋牛肝菌種群的進化機理。
針對“蘑菇中毒”的現象，楊祝良團隊下功夫開展毒蘑菇科普宣傳，并且開發(fā)了一款毒蘑菇識別App。
“未來我們將開展相關的基因組學研究，整合資源，加強學科集成和交叉，在充分利用西南地區(qū)真菌資源優(yōu)勢開展高水平研究的同時，也要重視資源開發(fā)利用研究，將資源優(yōu)勢轉變成經濟優(yōu)勢和發(fā)展優(yōu)勢，為脫貧攻堅貢獻力量。在科技脫貧中，我們推廣羊肚菌種植10000余畝，純收入逾1億元。”楊祝良說。
近日，中科院昆明植物所真菌多樣性與分子進化研究團隊有了新的發(fā)現，他們認為金針菇和毛腿冬菇是兩個完全不同的物種。為此，研究團隊給“金針菇”起了一個學名叫“F.filiformis”。
中科院昆明植物所研究員楊祝良告訴《中國科學報》記者：“近幾年，研究組在科技部‘973’項目的支持下，開展食用菌優(yōu)異種質性狀形成的遺傳基礎研究，金針菇就是其中一個重要的研究對象。解決金針菇的物種歸屬問題，是其他一切研究的基礎。如今在團隊的努力下，金針菇終于有了自己的‘戶口身份’證明。”
從中國冬菇屬分類開始的課題
金針菇喜歡低溫，常在冬季出菇，因此它又被稱為“冬菇”?？茖W家之前通過從冬菇個體上分離得到的菌株，再經過人工馴化、雜交、選育等過程，最終培育出了現在廣泛栽培的金針菇。
過去，科研人員曾對金針菇屬的物種多樣性開展過一些研究，發(fā)現東亞的金針菇與原初描述于歐洲的毛腿冬菇存在差異。但是，由于當時研究手段有限，這個問題一直懸而未決。
楊祝良告訴記者，2005年他指導當時的博士研究生葛再偉開展了中國冬菇屬的分類研究。雖然在《真菌多樣性》期刊發(fā)表了研究結果，但成果還有局限性。
“2014年‘973’項目啟動，于是我們又將金針菇的問題提到議事日程上，葛再偉的團隊對過去沒有解決的問題繼續(xù)進行梳理。”楊祝良說。
根據當時掌握的材料，研究團隊對我國的冬菇屬標本進行了研究。他們基于形態(tài)特征及內轉錄間隔區(qū)（ITS）的核苷酸序列分析，報道了中國的一個新記錄種和兩個新變種，其中一點就是將東亞的金針菇定名為毛腿冬菇絲蓋新變種（F. velutipes var. filiformis）。不過，這只是權宜之計。
楊祝良提到，在項目研究過程中，不少科學家給予了重要支持。中國農業(yè)科學院農業(yè)資源與農業(yè)區(qū)劃研究所研究員張金霞提供了一些重要菌株，北京林業(yè)大學教授戴玉成將團隊在我國北方和在歐洲采到的標本一并贈予楊祝良團隊進行研究。
“歐洲蘑菇研究權威專家、蘇黎世工業(yè)大學教授E. Horak和芬蘭的一位同行也加入到了該研究中，奧地利維也納大學標本館和美國田納西州立大學標本館也為我們提供了幫助。大家集思廣益后，在我指導下，由博士研究生王攀蒙開展具體研究工作，我們試圖充分利用現有研究材料來闡明金針菇的分類地位。”楊祝良說。
用基因組手段挖掘種質資源
在這項長達10余年的工作中，由于種種條件缺乏，研究團隊要面臨各種各樣的困難，其中最重要的一個就是標本質量不高、國外標本缺乏。
楊祝良說：“要證明東亞的金針菇與歐洲毛腿冬菇是相同還是不同，首先必須有采自兩地的充足的標本，標本質量要高，這樣才能開展分子水平的差異研究，從統(tǒng)計學上闡述二者的異同。”
為此，2006年借國際合作研究之機，楊祝良在德國采集了歐洲毛腿冬菇的標本。在多年野外標本采集和菌種分離積累的基礎上，他們通過與國內外研究者合作和館際互借，最終得到了該屬12個物種的88份高質量標本，克服了高質量標本缺乏的困難。
同時，由于種間形態(tài)上十分相似，選擇適合的分子標記就尤為重要。研究中團隊發(fā)現，目前常用的分子標記片段并不能很好地解決“金針菇”的分類地位問題。尋求其他分子標記，例如交配型基因的差異，就成為當務之急。
“當時國內外很少有用擔子菌交配型基因的核苷酸序列來開展相關研究，因此能夠供借鑒的成果有限。我們就根據已發(fā)表的金針菇交配型基因文獻資料，對冬菇屬所包含的四種類型的交配型基因都作了相關測試。”楊祝良表示。
經過團隊的不斷摸索，他們最終篩選出了適合系統(tǒng)發(fā)育分析的交配型基因片段，為后續(xù)的真菌分類學研究提供了新的思路。
楊祝良告訴記者，研究團隊用交配型基因構建的系統(tǒng)發(fā)育樹，在認識冬菇屬物種多樣性方面很有幫助，冬菇屬的個別物種可能需要重新界定。“另外，我們系統(tǒng)地研究了冬菇屬物種的多樣性，這對資源利用和產業(yè)發(fā)展可以提供指導，為今后基于基因組、基因工程等手段精準挖掘和利用該屬種質資源提供了基礎性的科學依據。”楊祝良說。
致力真菌分類學研究
清代文學家方苞曾說過“蓋將天開以成務，必先分類而知名”，只有掌握了自然界各類生物和物體的名字，才能認識自然界并與之和諧相處。楊祝良表示，物種是生物學一切學科研究的基礎，真菌也不例外。
近年來，他帶領團隊開展真菌的多樣性、系統(tǒng)發(fā)育、生物地理及分子進化等研究工作。除了金針菇，團隊對牛肝菌科、鵝膏科及蘑菇科真菌也有較為系統(tǒng)深入的研究。他們提出了牛肝菌科內各亞科和部分屬種劃分的“形態(tài)—分子標準”，發(fā)表了牛肝菌科的4個新亞科、13個新屬和72個新種，引領了牛肝菌科真菌的精準分類。與此同時，團隊也揭示了松塔牛肝菌屬的非洲起源與全球分布格局形成機制，明晰了網蓋牛肝菌種群的進化機理。
針對“蘑菇中毒”的現象，楊祝良團隊下功夫開展毒蘑菇科普宣傳，并且開發(fā)了一款毒蘑菇識別App。
“未來我們將開展相關的基因組學研究，整合資源，加強學科集成和交叉，在充分利用西南地區(qū)真菌資源優(yōu)勢開展高水平研究的同時，也要重視資源開發(fā)利用研究，將資源優(yōu)勢轉變成經濟優(yōu)勢和發(fā)展優(yōu)勢，為脫貧攻堅貢獻力量。在科技脫貧中，我們推廣羊肚菌種植10000余畝，純收入逾1億元。”楊祝良說。
