雜菌與食用菌的關(guān)系相當于雜草與綠色作物的關(guān)系，它們并不像病原菌那樣直接侵害食用菌，而是通過在培養(yǎng)基質(zhì)上的生長，與食用菌爭奪養(yǎng)分，同時形成毒素，抑制食用菌生長。危害食用菌的雜菌主要是霉菌類和少數(shù)的高等真菌、細菌及黏菌。
1.熟料栽培的雜菌控制。熟料栽培的雜菌污染源主要有培養(yǎng)料帶菌（滅菌不徹底）、菌種帶菌、接種工具帶菌（滅菌不徹底）、接種操作外界雜菌侵入和培養(yǎng)期間的外界雜菌侵入等。據(jù)此，防治要點應(yīng)在于：
?、龠x用潔凈新鮮無霉變的原料，并徹底滅菌。這是預(yù)防雜菌污染的第一道防線。
?、谡J真挑選菌種，杜絕菌種帶雜菌。
?、劭茖W(xué)配料，控制水分和ph值，創(chuàng)造不利于雜菌侵染的基質(zhì)條件。經(jīng)驗表明，料中麥麩多或加入糖后，霉菌污染率較高。當用豆粉或餅肥粉代替部分麥麩，并無糖時，霉菌污染率可明顯降低。含水量偏高時，霉菌污染發(fā)生多，含水量偏低時，霉菌污染發(fā)生少。
?、車栏窠臃N，嚴把操作關(guān)。
⑤創(chuàng)造適宜的培養(yǎng)條件，特別要注意場所潔凈、干燥，以減少外界雜菌的侵染。
