雙孢蘑菇的栽培過(guò)程中，常多生如下病害：
　　軟腐病
    又叫霉菌病、菌被病。感病初期，在菌床上形成一層白色菌絲，似棉絮狀，擴(kuò)展后，覆蓋整個(gè)床面，造成出菇減少或不出菇。
    該菌喜在有機(jī)質(zhì)豐富且潮濕的土壤中生長(zhǎng)。在高溫、高濕和培養(yǎng)料含水量偏高的條件下，生長(zhǎng)繁殖快。
    防治方法：培養(yǎng)料要進(jìn)行高溫堆積發(fā)酵；覆蓋用土要取地表下層土且拌入1%～2%的石灰粉拌勻土粒；減少床面噴水，加強(qiáng)菇房通風(fēng)；在患病部位撒石灰可預(yù)防本病的流行；出現(xiàn)該病后，及時(shí)排除病菇，并噴灑50%多菌靈1000倍液或2%～5%的甲醛溶液等殺菌劑進(jìn)行處理。
　　魚(yú)子菌
    在培養(yǎng)料上長(zhǎng)出許多圓形米黃色小顆粒，形如魚(yú)子，故稱(chēng)為“魚(yú)子菌”，該菌除了與蘑菇爭(zhēng)奪養(yǎng)分外，還分泌毒素，散發(fā)出腥臭味，擬制蘑菇菌絲生長(zhǎng)，造成減產(chǎn)。
    培養(yǎng)料發(fā)酵不良，形成“夾生料”；濕度過(guò)大，培養(yǎng)料偏酸性，以及培養(yǎng)料成團(tuán)變黑變黏，就會(huì)引起魚(yú)子病的發(fā)生。
    防治方法：培養(yǎng)料要發(fā)酵徹底，堆制發(fā)酵時(shí)間不宜過(guò)短；控制好培養(yǎng)料水分和酸堿度，培養(yǎng)料含水量以手握料不滴水為宜；培養(yǎng)料要疏松，不黏結(jié)成團(tuán)，不發(fā)黑，無(wú)臭味，PH值為7.5～7.8；出現(xiàn)魚(yú)子菌后，停止噴水，用300～500倍波爾多液澆灌，抑制病原菌的擴(kuò)展。
　　木霉
    木霉又叫綠色霉菌，菌絲初為白色棉絮狀，產(chǎn)生孢子后逐漸變綠色，最后呈黑綠色。它能產(chǎn)生毒素，抑制蘑菇菌絲的生長(zhǎng)，產(chǎn)生毒素致死幼菇。
    該病菌通過(guò)孢子傳播感染，培養(yǎng)料堆制發(fā)酵不良和菌種生長(zhǎng)良時(shí)，易感染木霉類(lèi)雜菌。而孢子主要靠空氣傳播，當(dāng)接種消毒不嚴(yán)栽培環(huán)境不衛(wèi)生時(shí)，也極易感染病菌。
    防治方法：培養(yǎng)料要求新鮮、干燥，嚴(yán)格按照堆制發(fā)酵程序進(jìn)行，堆制發(fā)酵要充分，最好用1%石灰加0.1%多菌靈拌料；播種用菌種要求無(wú)木霉感染，生長(zhǎng)健壯，菌絲體濃密，菌齡短；當(dāng)病害點(diǎn)狀發(fā)生時(shí)，將霉點(diǎn)去掉，用石灰或濃石灰水覆蓋發(fā)病部位；如果木霉菌侵染嚴(yán)重，可用50%多菌靈1000倍液，或克霉靈1000倍液進(jìn)行局部澆灌，抑制木霉菌擴(kuò)展。
　　青霉
    青霉在土壤中繁殖后，它與食用菌爭(zhēng)奪營(yíng)養(yǎng)、水分，并分泌毒素抑制雙孢蘑菇菌絲體向土壤中生長(zhǎng)，在料面上形成深綠色至藍(lán)綠色的菌落，老的菌落表面交織在一起形成一層膜狀物，隔斷料面吸收空氣，從而造成不出菇。
    土壤中含有有機(jī)質(zhì)和秸稈較高，并帶有青霉菌是造成病害發(fā)生的主要原因。通風(fēng)差、濕度大、悶熱，也易導(dǎo)致青霉的大量發(fā)生。
    防治方法：覆蓋土壤應(yīng)去掉表層土壤，取下層土壤覆蓋；培養(yǎng)料用1%石灰加0.1%多菌靈拌勻；點(diǎn)狀發(fā)生時(shí)，用50%多菌靈1000倍液進(jìn)行澆灌感病部位，抑制青霉擴(kuò)展；菌床上噴灑0.2%的多菌靈、代森鋅等；感染嚴(yán)重的并且面積較大時(shí)，應(yīng)去掉覆蓋的土壤，噴灑殺菌劑后，再覆蓋新鮮土壤。
　　褐斑病
    又叫斑點(diǎn)病、凹斑病。子實(shí)體感病后，首先長(zhǎng)出白色絨毛狀菌落，隨后在菌蓋上出現(xiàn)褐色凹陷病斑，其內(nèi)充滿(mǎn)分生孢子，受害的菇畸形，菌柄腫大或彎曲，最后枯死，但菇體不腐爛，無(wú)臭味。
    自然條件下，該病生長(zhǎng)在水稻田土禳中，在溫度偏高的條件下易發(fā)病，能通過(guò)覆土和噴水時(shí)傳染。
    防治方法：培養(yǎng)料要進(jìn)行充分的腐熟發(fā)酵；覆土材料要取下層土壤，用甲醛噴灑后，塑料薄膜覆蓋悶殺24小時(shí)；覆蓋在菌床上的草簾要經(jīng)常調(diào)換覆蓋面，不宜一直只用同一面覆蓋，否則在草簾受潮后，孳生雜菌而傳染蘑菇子實(shí)體，同時(shí)在草簾上噴灑50%多菌靈1000倍液等殺菌消毒；保濕用水要使用清潔井水或河水，不能使用污水；氣溫較高時(shí)，要加強(qiáng)通風(fēng)換氣，降低濕度；出現(xiàn)該病后，及時(shí)去掉病菇，并停止噴水，噴灑2%次氯酸鈣或2%～5%甲醛或500倍多菌靈溶液。
　　銹斑病
    蘑菇子實(shí)體上出現(xiàn)銹色斑點(diǎn)，或者為褐色斑點(diǎn)，與褐斑病不同的是不產(chǎn)生凹陷。
    該病原菌生活在土壤和不清潔水中。在高溫、高濕條件下危害嚴(yán)重。
    防治方法：所噴水要使用清潔井水或河水，不能使用污水，以免水中帶菌傳染；加強(qiáng)通風(fēng)換氣，降低溫度和濕度，溫度控制在20℃以?xún)?nèi)，濕度保持在85%～95%之間；出現(xiàn)病害后，摘除病菇，然后噴灑多菌靈、克菌等殺菌劑。
　　菌絲體徒長(zhǎng)
    雙孢蘑菇的料床覆土后，菌絲沿著土粒不斷向表層生長(zhǎng)，形成一層濃密的菌絲層，結(jié)果造成出菇推遲或很少出菇，從而降低質(zhì)量和產(chǎn)量。
    發(fā)生原因：培養(yǎng)料腐熟過(guò)度，含氮量及含水量過(guò)高，容易引起氣生型菌絲徒長(zhǎng)。棚內(nèi)通風(fēng)不良，溫度超過(guò)22℃，空氣相對(duì)濕度太高等也易造成菌絲體徒長(zhǎng)。
    防治方法：調(diào)水不要過(guò)輕，細(xì)土噴水不要太急，要在早晚涼爽時(shí)噴水；要加強(qiáng)通風(fēng)，控制菇棚內(nèi)的溫度；覆土層菌絲徒長(zhǎng)較輕的，再覆一層薄土，較重的用刀子劃破菌皮，挑掉菌塊，補(bǔ)覆細(xì)土，噴重水，增大通風(fēng)。
　　地雷菇
    子實(shí)體在土壤中生長(zhǎng)，受到土塊的壓抑；菌蓋上有泥土出菇凹凸不平，降低了蘑菇質(zhì)量，并影響了下一批蘑菇。
    料堆過(guò)厚，且料中混有泥土，使幼菇在料深處形成。覆蓋的土層過(guò)厚或者含水量低，抑制了菌絲向土層的生長(zhǎng)，從而使幼菇在料內(nèi)形成。菇層內(nèi)空氣濕度太低，出菇過(guò)早，結(jié)菇部位低。
    防治方法：播種時(shí)，不能在培養(yǎng)料中混入土粒，以免在料層中土粒上結(jié)菇，造成結(jié)菇部位低，而無(wú)法長(zhǎng)出土表；覆蓋用土粒不宜過(guò)大，以免幼菇生長(zhǎng)無(wú)法頂破土粒而在土塊下面生長(zhǎng)，覆土也不要過(guò)厚，以3.5～4cm為宜；誘導(dǎo)出菇須及時(shí)，在菌絲生長(zhǎng)到距土壤表面1cm時(shí)，噴水誘導(dǎo)出菇；結(jié)菇部位低的菇要及時(shí)采收，以免長(zhǎng)大后變成畸形，特別是在春季，易出現(xiàn)地雷菇。