由于我國地域遼闊，栽培香菇的自然條件和栽培條件各不相同，因此在長期的栽培過程中，形成了許多不同的品種和品系。
目前生產(chǎn)上往往按菌蓋大小而劃分為大葉、中葉和小葉等品系，按菌蓋厚薄分為后肉、中肉、薄肉等品系，按出菇期分為春秋出菇、夏秋出菇、冬春出菇等品系。引種時要根據(jù)市場需求、當?shù)貧夂蚝驮耘嗉竟?jié)綜合考慮，確定主栽品種。
(1)中溫型菌株
秋冬春出菇（10～12月、2～5月），菌齡60～70天，出菇溫度一般為9～25℃，適于海拔300～500米地區(qū)栽培。
①l-26：福建省三明真菌研究所選育。朵大，外形美觀，肉肥厚，菌蓋深褐色或棕褐色，少有鱗片和纖毛；朵形圓整，柄細短。出菇中心溫度10～24℃，秋冬菇產(chǎn)量占20%～30%，春季出潮猛，品質(zhì)好、產(chǎn)量高，是現(xiàn)行速生高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)栽培最為理想的菌株。
②cr-66：福建省三明真菌研究所選育。朵大，圓整美觀，肉質(zhì)緊實；菌蓋茶褐色至深褐色，菌柄位正，中粗，適應性較強，種性穩(wěn)定。出菇中心溫度9～23℃，菌齡65～70天，秋春出菇量多，產(chǎn)量高。
③cr-62：福建省三明真菌研究所選育。中朵，肉質(zhì)厚度中等，柄細短；菌蓋黃褐色至茶褐色。適應性較強，出菇中心溫度9～23℃，菌齡65～70天，秋春出菇。
(2)中溫偏低型菌株
秋冬春出菇（10～12月、2～5月），菌齡60天左右。出菇中心溫度8～22℃，適于海拔500～700米地區(qū)栽培。
①l-856：福建省三明真菌研究所選育。中朵，單生或叢生，菌絲濃密，適應性強，菌蓋茶褐色至黃褐色，肉質(zhì)肥厚，柄正、細短。出菇中心溫度8～22℃。成批長菇，脫袋后邊轉(zhuǎn)色邊出菇，轉(zhuǎn)潮快，產(chǎn)量高而穩(wěn)。
②9018(8517)：上海農(nóng)業(yè)局菌種站定向選育。中葉種，叢生，菇形圓整，柄細短，菌蓋深褐色，鱗片明顯。出菇中心溫度12～18℃，秋冬春出菇，轉(zhuǎn)潮快，產(chǎn)量高。
③cr-02：福建省三明真菌研究所選育。中朵叢生，菌肉中厚，蓋黃褐色至茶褐色，鱗片明顯。出菇中心溫度8～22℃，菌齡55～60天。一般脫袋就出菇，頭潮菇多為畸形，轉(zhuǎn)潮快；后期朵小，肉薄，色淡。
④l-9612：大葉種，菌肉肥厚，菌蓋茶褐色至深褐色，菌褶較疏，柄短而細，產(chǎn)量高而穩(wěn)，菌齡60天左右。出菇中心溫度12～22℃，菌絲不夠成熟時過早脫袋，畸形菇較多，秋春季出菇量較多。
⑤9015：中溫偏低型菌株，適于海拔500米以上地區(qū)栽培。大朵種，朵形圓整，肉厚，產(chǎn)量高，菌蓋直徑4～14厘米，菌柄長3.5～5.5厘米，不易開膜。出菇中心溫度8～22℃，接種期的彈性較大，3～8月間均可，9月下旬至翌年5月出菇。菌筒轉(zhuǎn)色宜稍深稍厚，利用震動拍打法催蕾具有良好效果。
⑥241-4：閩北、浙南菇區(qū)主栽品種。中溫偏低型遲熟菌株，適于海拔500米以上地區(qū)栽培。大朵種，朵形圓整，菌蓋直徑6～10厘米，菌肉厚度1.8～2.2厘米，菌柄短而細，品質(zhì)優(yōu)，國外稱為“仿生菇”。菌絲生理成熟時間較長，菌齡180～200天，栽培季節(jié)彈性較大，高山區(qū)1～3月接種，是全國第一個大面積推廣應用的遲熟品種，管理容易，產(chǎn)量高。
(3)低溫型菌株
秋冬春出菇（10～12月、2～5月），菌齡60天左右，出菇中心溫度5～18℃。適于海拔500米以上山區(qū)和北方栽培。le-13：山西原平農(nóng)學院微生物室選育。中朵種，菇形圓整，肉厚，蓋褐色，柄粗短；生活力強，產(chǎn)量穩(wěn)定。出菇中心溫度8℃～18℃，轉(zhuǎn)潮快，秋冬春出菇。
②9101:吉林農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學系真菌研究所選育。大中種，單生，朵大肉厚，質(zhì)硬，褐色，抗污力強。出菇中心溫度7～18℃。適于北方高寒地區(qū)袋料栽培，也適于段木栽培。
③n-06：山東曲阜師范大學生物系選育。中葉種，朵中大，肉質(zhì)中厚，菌蓋褐色，抗雜菌能力強。秋春出菇，出菇中心溫度8～20℃，產(chǎn)量中等。
(4)中溫偏高型菌株
春秋出菇（10～12月、2～5月），菌齡70～80天，出菇中心溫度10～23℃，有的高達26℃，適于海拔300米以下地區(qū)栽培。
①蘇香1號：江蘇省農(nóng)業(yè)科學院微生物研究所選育。單生，朵形中大，菌蓋茶褐色或深褐色，柄中粗較短，菇質(zhì)好，抗逆性強。出菇中心溫度10～25℃，春夏出菇，產(chǎn)菇量多，產(chǎn)量高。
②廈亞1號：福建省亞熱帶植物研究所選育。大朵形，朵圓整，肥厚，顏色深褐，抗逆性強。出菇中心溫度10～25℃，秋春出菇。
③cr-04：福建省三明真菌研究所選育。大朵，形圓整，菌蓋肥厚，內(nèi)卷，蓋正中突起形成草帽狀，茶褐色；柄中粗，品質(zhì)優(yōu)良，抗逆性強。菌齡70～80天，出菇中心溫度10～23℃，春秋出菇，菇潮集中，產(chǎn)量高，為低海拔地區(qū)夏季出菇的理想菌株。
④武香1號：浙江武義食用菌研究所選育。大朵型，菌肉肥厚，菌蓋色較深，柄中粗，稍長。在28℃的高溫條件下能大量出菇，出菇中心溫度10～25℃，菌齡70天左右，適宜的接種期為3～4個月，出菇期5～11月。其抗逆性強，一般地區(qū)可作夏季出菇的首選品種。
(5)高溫型菌株
夏秋出菇（10～11月、3～6月），菌齡65～80天，出菇中心溫度為10～25℃，也有14～28℃的，適于300米以下低海拔地區(qū)栽培。
①8500:福建省農(nóng)業(yè)科學院土壤肥料研究所選育。單生，朵大肉厚，柄粗，菌蓋深褐色。出菇中心溫度13～26℃，產(chǎn)量高，單菇鮮重250克左右，含水率低，折干率高。冬季長菇量少，有畸形菇出現(xiàn)。
②廣香47：廣東省農(nóng)業(yè)科學院微生物研究所選育。單生，大朵厚肉，菌蓋黃褐色，出菇中心溫度14～28℃，多在5～6月、9～10月出菇。冬季長菇量極少，且畸形。
③8001:上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所選育。單生，朵中大，肉質(zhì)肥厚，茶褐色或深褐色，柄粗、正中，出菇中心溫度14～26℃，集中于夏秋季出菇，冬長畸形菇。
